В конце 870 года в Регенсбурге собралась баварская провинциальная синода под председательством архиепископа Зальцбургского Адальвина. Король Людовик Немецкий присутствовал лично. Перед судом стоял Мефодий — архиепископ, чей титул по факту перекрывал юрисдикцию обоих его судей.
Обвинение было простым: Мефодий вёл миссионерскую деятельность на территории епархий Зальцбурга и Пассау без разрешения местных прелатов. Формально — нарушение церковной субординации. По существу — Зальцбург и Пассау десятилетиями считали Моравию и Паннонию своей канонической территорией, а теперь явился человек с папской буллой, ставящей его выше них.
Синод приговорил Мефодия к многолетнему заключению. Его отправили в Германию — по одним данным в Элльванген, по другим в Эльванген под надзор епископа Пассауского Эрменриха, который сам же и арестовал его. Два с половиной года Мефодий провёл в монастырском плену.
Документы самого синода не сохранились — о процессе известно из четырёх писем папы Адриана II и из «Жития Мефодия». Архиепископ Сирмийский, рукоположенный в Риме с прямым папским благословением, сидел в баварской тюрьме по приговору собственных церковных конкурентов.