«Тополь-М» стал первым межконтинентальным баллистическим комплексом, полностью разработанным и испытанным в постсоветской России — разработку поручили Московскому институту теплотехники ещё указом Бориса Ельцина в 1993 году. Первый успешный пуск шахтного варианта состоялся в декабре 1994 года на космодроме Плесецк.
28 апреля 2000 года госкомиссия утвердила акт о принятии ракеты на вооружение Ракетных войск стратегического назначения, а президент Владимир Путин летом того же года подписал соответствующий указ. Параллельно начались испытания подвижного грунтового варианта комплекса на восьмиосном шасси — принципиально нового решения по сравнению с прежними мобильными «Тополями».
К 2001 году программа лётных испытаний шахтного варианта включала уже десять пусков с Плесецка, из которых только один, в 1998 году, оказался неудачным — редкий для новой техники показатель надёжности. Испытания подтверждали не только боеспособность самой ракеты, но и устойчивость всей кооперации разработчиков после распада прежней оборонной промышленности.
24 марта 2001 года указом президента были образованы Космические войска России, взявшие на себя, среди прочего, управление испытательным полигоном в Плесецке.
«Тополь-М» стал доказательством того, что даже в условиях девяностых у страны хватило воли довести стратегический проект от чертежа до боевого дежурства.